Tempoh Penumpahan Virus Kultur dalam Jangkitan Omicron (BA.1) SARS-CoV-2 | NEJM

Kepada Editor:

Varian B.1.1.529 (omicron) bagi sindrom pernafasan akut teruk coronavirus 2 (SARS-CoV-2) mempunyai tempoh inkubasi yang lebih pendek dan kadar penghantaran yang lebih tinggi daripada varian sebelumnya.1,2 Baru-baru ini, Pusat Kawalan dan Pencegahan Penyakit mengesyorkan memendekkan tempoh pengasingan yang ketat untuk orang yang dijangkiti dalam tetapan bukan penjagaan kesihatan daripada 10 hari kepada 5 hari selepas timbulnya gejala atau selepas ujian awal positif, diikuti dengan 5 hari penutupan.3 Walau bagaimanapun, kinetik pereputan virus bagi varian omikron dan tempoh penumpahan virus yang boleh dikultur belum dicirikan dengan baik.

Kami menggunakan pensampelan longitudinal swab hidung untuk penentuan viral load, penjujukan dan budaya virus pada pesakit luar dengan penyakit coronavirus 2019 (Covid-19) yang baru didiagnosis.4 Dari Julai 2021 hingga Januari 2022, kami mendaftarkan 66 peserta, termasuk 32 dengan sampel yang disusun dan dikenal pasti sebagai varian B.1.617.2 (delta) dan 34 dengan sampel yang disusun dan dikenal pasti sebagai subvarian omikron BA.1, inklusif daripada sublineages. Peserta yang menerima terapi khusus Covid-19 dikecualikan; semua kecuali 1 peserta mempunyai jangkitan simptomatik. Kajian ini telah diluluskan oleh lembaga semakan institusi dan jawatankuasa biokeselamatan institusi di Mass General Brigham, dan persetujuan termaklum diperoleh daripada semua peserta.

nejmc2202092 f1Pereputan Viral dan Masa kepada Budaya Viral Negatif.

Panel A menunjukkan pereputan beban virus dari masa ujian tindak balas rantai polimerase (PCR) positif pertama. Beban virus daripada sampel sapuan hidung yang diperoleh daripada peserta individu ditunjukkan. Setiap bulatan atau segi tiga mewakili sampel yang diperoleh pada hari yang ditentukan. Muatan virus median pada setiap titik masa untuk setiap varian juga ditunjukkan. LOD menandakan had pengesanan. Panel B hingga E menunjukkan lengkung kelangsungan hidup Kaplan–Meier untuk masa daripada ujian PCR positif awal kepada ujian PCR negatif, mengikut varian virus (Panel B) dan status vaksinasi (Panel D), dan masa daripada ujian PCR positif awal kepada budaya virus negatif, mengikut varian virus (Panel C) dan status vaksinasi (Panel E). Dalam semua panel, kawasan berlorek menunjukkan selang keyakinan 95%. Penjujukan menunjukkan bahawa semua strain varian omikron ialah subvarian BA.1, termasuk sublineages.

Ciri-ciri peserta adalah serupa dalam dua kumpulan varian kecuali lebih ramai peserta dengan jangkitan omicron telah menerima vaksin penggalak berbanding mereka yang mempunyai jangkitan delta (35% vs. 3%) (Jadual S1 dan S2 dalam Lampiran Tambahan, tersedia dengan teks penuh surat ini di NEJM.org). Dalam analisis yang menggunakan model bahaya berkadar Cox yang diselaraskan untuk umur, jantina dan status vaksinasi, bilangan hari daripada ujian tindak balas rantai polimerase (PCR) positif awal kepada ujian PCR negatif (nisbah bahaya terlaras , 0.61; selang keyakinan 95%. [CI]0.33 hingga 1.15) dan bilangan hari daripada ujian PCR positif awal kepada penukaran budaya (nisbah bahaya terlaras, 0.77; 95% CI, 0.44 hingga 1.37) adalah serupa dalam dua kumpulan varian (Rajah 1A hingga 1C dan S1 hingga S3, dan Jadual S3 hingga S5). Masa median daripada ujian PCR positif awal kepada penukaran budaya ialah 4 hari (julat interkuartil, 3 hingga 5) dalam kumpulan delta dan 5 hari (julat interkuartil, 3 hingga 9) dalam kumpulan omikron; masa median dari permulaan simptom atau ujian PCR positif awal, yang mana lebih awal, kepada penukaran budaya ialah 6 hari (julat antara kuartil, 4 hingga 7) dan 8 hari (julat antara kuartil, 5 hingga 10), masing-masing. Tidak terdapat perbezaan antara kumpulan yang ketara dalam masa penukaran PCR atau penukaran budaya mengikut status vaksinasi, walaupun saiz sampel agak kecil, yang membawa kepada ketidaktepatan dalam anggaran (Rajah 1D dan 1E).

Dalam kohort membujur peserta ini, yang kebanyakannya mempunyai simptom, jangkitan Covid-19 yang tidak teruk, kinetik pereputan virus adalah serupa dengan jangkitan omicron dan jangkitan delta. Walaupun vaksinasi telah ditunjukkan untuk mengurangkan kejadian jangkitan dan keterukan penyakit, kami tidak menemui perbezaan besar dalam tempoh median penumpahan virus di kalangan peserta yang tidak divaksinasi, mereka yang telah divaksinasi tetapi tidak dirangsang, dan mereka yang telah divaksinasi dan dirangsang.

Keputusan kami harus ditafsirkan dalam konteks saiz sampel yang kecil, yang mengehadkan ketepatan, dan kemungkinan pengelirukan sisa dalam perbandingan mengikut varian, status vaksinasi dan tempoh masa jangkitan. Walaupun kepositifan budaya telah dicadangkan sebagai proksi yang mungkin untuk jangkitan,5 kajian tambahan diperlukan untuk mengaitkan positif budaya virus dengan penghantaran yang disahkan untuk memaklumkan tempoh pengasingan. Data kami mencadangkan bahawa sesetengah orang yang dijangkiti varian omicron dan delta SARS-CoV-2 menumpahkan virus yang boleh dibiakkan lebih daripada 5 hari selepas permulaan simptom atau ujian awal positif.

Julie Boucau, Ph.D.
Caitlin Marino, BS
Institut Ragon, Cambridge, MA

James Regan, BS
Brigham dan Hospital Wanita, Boston, MA

Rockib Uddin, BS
Hospital Besar Massachusetts, Boston, MA

Manish C. Choudhary, Ph.D.
James P. Flynn, BS
Brigham dan Hospital Wanita, Boston, MA

Geoffrey Chen, BA
Ashley M. Stuckwisch, BS
Josh Mathews, AB
May Y. Liew, BA
Arshdeep Singh, BS
Taryn Lipiner, MPH
Hospital Besar Massachusetts, Boston, MA

Musim luruh Kittilson, BS
Meghan Melberg, BS
Yijia Li, MD
Brigham dan Hospital Wanita, Boston, MA

Rebecca F. Gilbert, BA
Zahra Reynolds, MPH
Surabhi L. Iyer, BA
Grace C. Chamberlin, BA
Tammy D. Vyas, BS
Marcia B. Goldberg, MD
Jatin M. Vyas, MD, Ph.D.
Hospital Besar Massachusetts, Boston, MA

Jonathan Z. Li, MD
Brigham dan Hospital Wanita, Boston, MA

Jacob E. Lemieux, MD, D.Phil.
Mark J. Siedner, MD, MPH
Amy K. Barczak, MD
Hospital Besar Massachusetts, Boston, MA

Disokong oleh geran (kepada Dr. Goldberg, JZ Li, Lemieux, Siedner, dan Barczak) daripada Konsortium Massachusetts untuk Kesediaan Patogenpemberian (kepada Dr. Vyas) daripada Jabatan Perubatan Hospital Besar Massachusettsdan geran (P30 AI060354, kepada makmal BSL3 tempat kerja kultur virus dilakukan) daripada Pusat Penyelidikan Sindrom Kurang Daya Tahan Universiti Harvard.

Borang pendedahan yang disediakan oleh pengarang boleh didapati dengan teks penuh surat ini di NEJM.org.

Surat ini diterbitkan pada 29 Jun 2022, di NEJM.org.

Dr. JZ Li, Lemieux, Siedner, dan Barczak menyumbang sama kepada surat ini.

  1. 1. Abbott S, Sherratt K, Gerstung M, Funk S. Anggaran ujian untuk menguji pengedaran sebagai proksi untuk pengedaran selang penjanaan untuk varian omicron di England. Januari 10, 2022 (https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2022.01.08.22268920v1). pracetak.

  2. 2. Tidak mengapa, Piantham C, Nishiura H. Bilangan pembiakan segera relatif bagi varian SARS-CoV-2 omicron berkenaan dengan varian delta di Denmark. J Med Virol 2022;94:22652268.

  3. 3. Pusat Kawalan dan Pencegahan Penyakit. CDC mengemas kini dan memendekkan tempoh pengasingan dan kuarantin yang disyorkan untuk populasi umum. Disember 27, 2021 (https://www.cdc.gov/media/releases/2021/s1227-isolation-quarantine-guidance.html).

  4. 4. Siedner MJ, Boucau J, Gilbert RF, et al. Tempoh penumpahan virus dan kultur positif dengan jangkitan varian delta SARS-CoV-2 pasca vaksinasi. JCI Insight 2022;7(2):e155483e155483.

  5. 5. Wölfel R, Corman VM, Guggemos W, et al. Penilaian virologi pesakit dimasukkan ke hospital dengan COVID-2019. alam semula jadi 2020;581:465469.

We want to thank the author of this write-up for this amazing web content

Tempoh Penumpahan Virus Kultur dalam Jangkitan Omicron (BA.1) SARS-CoV-2 | NEJM


You can view our social media profiles here , as well as other pages related to them here.https://paw6.info/related-pages/